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识别位点： TTAA 5'...T ↓ T A A...3' 3'...A A T ↑ T...5' 同裂酶：SaqAI, Tru9I, Tru1I 注：同裂酶对于不同的甲基化修饰可能具有不同敏感性。 -
识别位点： TGGCCA 5'...T G G ↓ C C A...3' 3'...A C C ↑ G G T...5' 同裂酶：BalI, MlsI, Mox20I, Msp20I 注：同裂酶对于不同的甲基化修饰可能具有不同敏感性。
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识别位点： CCTC(7/6) 5'...C C T C N₇ ↓...3' 3'...G G A G N₆ ↑...5'
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识别位点： ACGCGT 5'...A ↓ C G C G T...3' 3'...T G C G C ↑ A...5'
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识别位点： GATC 5'...↓G A T C ...3' 3'... C T A G↑...5' 同裂酶：Bsp143I, Kzo9I, BssMI, DpnII, BstMBI, NdeII, Sau3AI 异裂酶：BstKTI 注：同裂酶对于不同的甲基化修饰可能具有不同敏感性。
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识别位点： GGTACC 5'...G G T A C ↓ C...3' 3'...C ↑ C A T G G...5' 异裂酶：Asp718I, Acc65I 注：同裂酶对于不同的甲基化修饰可能具有不同敏感性。
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识别位点： GGCGCC 5'...G ↓ G C G C C...3' 3'...C C G C G ↑ G...5' 同裂酶：SspDI 异裂酶：Mly113I, EgeI, NarI, EheI, DinI, SfoI, PluTI 注：同裂酶对于不同的甲基化修饰可能具有不同敏感性。
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识别位点： CCGG 5'...C ↓ C G G...3' 3'...G G C ↑ C...5' 同裂酶：MspI, HapII, BsiSI 注：同裂酶对于不同的甲基化修饰可能具有不同敏感性。
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识别位点： GTTAAC 5'...G T T ↓ A A C...3' 3'...C A A ↑ T T G...5' 同裂酶：KspAI 注：同裂酶对于不同的甲基化修饰可能具有不同敏感性。
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识别位点： GCGC 5'...G ↓ C G C...3' 3'...C G C ↑ G...5' 同裂酶：HhaI, CfoI, AspLEI, Hin6I, HspAI, BstHHI 注：同裂酶对于不同的甲基化修饰可能具有不同敏感性。
