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识别位点： GCTCTTC(1/4) 5'...G C T C T T C (N)₁↓...3' 3'...C G A G A A G (N)₄↑...5' 同裂酶：BspQI, LguI, PciSI 注：同裂酶对于不同的甲基化修饰也许具有不同敏感性。 -
识别位点： GTCGAC 5'...G ↓ T C G A C...3' 3'...C A G C T ↑ G...5'
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识别位点： CCGCGG 5'...C C G C ↓ G G...3' 3'...G G ↑ C G C C...5' 同裂酶：Cfr42I，KspI，Sfr303I，SgrBI 注：同裂酶对于不同的甲基化修饰也许具有不同敏感性。
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识别位点： GTAC 5'...G T ↓ A C...3' 3'...C A ↑ T G...5' 同裂酶：AfaI 异裂酶：Csp6I, CviQI, RsaNI 注：同裂酶对于不同的甲基化修饰也许具有不同敏感性。
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识别位点： CAGCTG 5'...C A G ↓ C T G...3' 3'...G T C ↑ G A C...5'
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识别位点： CGATCG 5'...C G A T ↓ C G...3' 3'...G C ↑ T A G C...5' 同裂酶：Ple19I 注：同裂酶对于不同的甲基化修饰也许具有不同敏感性。
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识别位点： CTGCAG 5'...C T G C A ↓ G...3' 3'...G ↑ A C G T C...5' 同裂酶：BspMAI 注：同裂酶对于不同的甲基化修饰也许具有不同敏感性。
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识别位点： CCWGG 5'...↓C C W G G ...3' 3'... G G W C C↑...5' 同裂酶：EcoRII, Psp6I, AjnI 异裂酶：BciT130I, BseBI, Bst2UI, BstNI, MvaI 注：同裂酶对于不同的甲基化修饰也许具有不同敏感性。
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识别位点： CACGTG 5'...CAC ↓ GTG...3' 3'...GTG ↑ CAC ..5' 同裂酶：AcvI, Eco72I, PspCI, BbrPI 注：同裂酶对于不同的甲基化修饰也许具有不同敏感性。
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识别位点： GTTTAAAC 5'...G T T T ↓ A A A C...3' 3'...C A A A ↑ T T T G...5' 同裂酶：MssI 注：同裂酶对于不同的甲基化修饰也许具有不同敏感性。
